Кыштовская ЦРБ была включена в ведомственную целевую программу «Укрепление материально-технической базы государственных бюджетных учреждений, подведомственных министерству здравоохранения Новосибирской области, на период 2011-2013 годы».

Работы по реконструкции одного из корпусов больницы были начаты в 2010 году. На сегодняшний день все работы по данному этапу завершены.

В реконструированный корпус переведено хирургическое отделение с оперативным блоком, реанимационное отделение, терапия, также в нем временно расположилось детское и взрослое поликлиническое отделение и родильное отделение.

Работы по реконструкции ЦРБ будут продолжены и дальше. В здании еще одного корпуса, где сейчас ведутся работы, будет размещено детское и взрослое поликлиническое отделение.